基因测序服务
基于 Illumina NovaSeq、Oxford Nanopore、PacBio Sequel 等主流测序平台，提供从样本到数据的一站式测序服务，覆盖人、动物、植物、微生物全物种。
服务内容
- 全基因组测序（WGS）
- 全外显子测序（WES）
- 靶向区域测序
- 简化基因组测序（GBS / RAD-seq）
- 16S / 18S / ITS 扩增子测序
- 宏基因组测序
- 转录组测序（有参 / 无参）
- Bisulfite 甲基化测序
转录组学分析
从差异表达到功能解读，系统解析基因表达调控规律，挖掘关键基因与通路。
分析内容
- 差异表达基因分析（DESeq2 / edgeR）
- GO / KEGG 功能富集分析
- GSEA 基因集富集分析
- WGCNA 共表达网络
- 可变剪接分析（rMATS）
- lncRNA 靶基因预测
- miRNA-mRNA 调控网络
- ceRNA 网络构建
单细胞测序分析
从细胞聚类到轨迹推断，深入解析细胞异质性与发育动态。
分析内容
- 细胞聚类与注释（Seurat / Scanpy）
- 拟时序分析（Monocle3 / Slingshot）
- 细胞通讯分析（CellChat）
- 转录因子调控网络（SCENIC）
- 差异基因与标记基因
- 细胞周期推断
- 空间转录组分析
- 单细胞 ATAC 分析
表观遗传学分析
揭示基因调控的表观层面机制，解析染色质结构与调控元件。
分析内容
- DNA 甲基化分析（BS-seq）
- 差异甲基化区域（DMR）识别
- ChIP-seq 峰检测与注释
- ATAC-seq 开放染色质分析
- Hi-C / TAD 分析
- 组蛋白修饰分析
- 转录因子结合位点
- 表观-转录联合分析
群体遗传与 GWAS 分析
解析群体遗传结构，定位性状关联位点，揭示进化与驯化机制。
分析内容
- 群体变异检测与注释
- 群体结构分析（PCA / ADMIXTURE）
- GWAS 关联分析（GEMMA / GCTA / PLINK）
- 选择消除分析（FST / π / Tajima's D）
- 系统进化树构建
- 连锁不平衡分析
- 候选基因挖掘
- 孟德尔随机化分析
多组学整合分析
整合基因组、转录组、表观组、代谢组等多维度数据，构建系统生物学视图。
分析内容
- eQTL / pQTL 分析
- TWAS 全转录组关联分析
- 共定位分析（coloc）
- SMR / TWAS 整合
- 多组学网络构建
- WGCNA 跨组学模块
- 代谢组-转录组联合
- 多组学因子分析（MOFA）
蛋白质组学与代谢组学
从蛋白与代谢层面揭示生命活动规律，互补基因组与转录组数据。
分析内容
- TMT / iTRAQ 定量蛋白组
- DIA / DDA 蛋白组
- 差异蛋白分析
- 非靶向代谢组
- 靶向代谢组
- 脂质组分析
- 通路富集与拓扑分析
- 蛋白-代谢联合分析
个性化分析定制
标准流程无法满足？博士级分析师团队可根据具体研究问题定制分析方案，包括方法开发、流程搭建与结果解读。
服务范围
- 自定义分析流程开发
- R / Python 脚本与工具开发
- 公开数据挖掘（GEO / TCGA 等）
- 论文图表绘制与美化
- 生信方法学评估
- 数据分析方案设计